Biomodeller / Biomodels forår 2003

Kursusplan

Indhold

Kort beskrivelse

Der er forelæsninger i 5 à 6 uger i februar-marts og enkelte øvelser ved computere i samme periode. Forelæsningerne holdes i lokale T.663 på 6. sal i højhusets nordende tirsdag 11,10 - 12,30 og fredag 8,00 - 9,20. Som hovedregel (men ikke konsekvent) er det om tirsdagen matematik og generel modelleringsteori, der gennemgås af Poul Einer Hansen (PEH), om fredagen indføring i det matematikorienterede computersprog Maple 6, ved Henrik Laurberg Pedersen (HLP). Øvelseslokale og -tidspunkt aftales nærmere ved de første forelæsninger. Fra midten af marts foregår undervisningen fortrinsvis som vejledning i grupper, typisk på 2 personer (men "grupper" på 1 er også i orden) omkring individuelle mini-modelleringsprojekter. Disse bør altså være besluttet ca. i midten af marts. Der træffes aftale om at udnytte 1 à 2 forelæsningsgange i slutningen af semestret, hvor deltagerne kan fremlægge deres projekter for hinanden og få dem diskuteret. Projektrapporter skal afleveres senest ved udgangen af maj, men af hensyn til andre eksamener vil det være en god ide at få gjort rapporten færdig inden 20. maj.

Lærere

PEH = Poul Einer Hansen, lokale T.632, tlf. 3528.2338, mail: peh@kvl.dk
HLP = Henrik Laurberg Pedersen, lokale T.634, tlf. 3528.2325, mail: henrikp@dina.kvl.dk

Kursusmateriale

Til matematikdelen udleveres flg. noter (på papir):

Til Mapledelen findes en række undervisningsfiler, udarbejdet som såkaldte "Maple worksheets". De findes under undervisningsmateriale på vores hjemmeside. Der er også links direkte fra forelæsningsplanen nedenfor.


Forelæsningsplan

Dato

Forelæser


Indhold

Pensum

Opgaver

Øvelser

Uge 6 Introduktion til biologiske modeller. Linær algebra
4. feb. PEH
 Generel introduktion. Lineær algebra.
  DM s. 1-15,
 MT s. 533-545. 		  Ingen øvelser.
7 feb. HLP
Introduktion til Maple. Lineær algebra i Maple.
 Maple: Kap 1, 2
  
Uge 7 Differentialligninger

11. feb.

PEH


Lineær algebra. Differentialligninger.
 MT s. 545-556.
   Ingen øvelser.

14. feb.

HLP


Løsning af differentialligninger i Maple.
 Maple: Kap 3
 Intro opgaver
Uge 8 Biomodeller I
18. feb.

HLP


Samhørende differentialligninger i Maple. Maple: Kap 3   EDB Introduktion + Opgaver i Kap 1 og 2
21. feb.

HLP


Biomodeller: eksempler i Maple.
Lin. diff. opgaver
Uge 9 Biomodeller II
25. feb.

PEH


Ligevægt og stabilitet. Kemostaten og andre modeleksempler.
  Øvelser i lin. diff. lign.
28. feb.

HLP


Parameterbestemmelse. Retningsfelt. DM: side 15-22, MT: side 561-566 Opgaver i typer af sing. pkt.
Uge 10 Partielle differentialligninger
4. marts

PEH


Partielle differentialligninger.

  Klassificering af sing. pkt./lineær. algebra.
7. marts

Ingen forelæsning.
Årsfest.
 
Uge 11
 Afslutning af den teoretiske del
11. marts

PEH


Eksempler på miniprojekter i kurset. Modellering.
 DM (overblik)
   Opgave i regression
14. marts

HLP


Partielle differentialligninger i Maple. Evt. programmering i Maple. Eksempler. Gruppevalg
 


Endvidere benyttes 1 forelæsningsgang i starten af maj og evt. også 1 gang i starten af april til projektfremlæggelse samt kursusevaluering

Hjemmeopgaver / Opgavesæt

I tilknytning til PEHs forelæsninger anbefales det, at deltagerne efter behov regner nogle af opgaverne i notatet MT. Opgaverne kan afleveres til PEH, når det passer den enkelte, og vil blive rettet grundigt og leveret tilbage hurtigst muligt.

Projekter

Fra ca. 15. marts til semestrets slutningen i maj er der ingen forelæsninger og øvelser. Her går kursusaktiviteten ud på, at deltagerne i grupper udfører individuelle projekter og skriver en rapport herom. Rapporten udarbejdes som et Maple worksheet, dvs. en fil). Man kan evt. udforme rapporten på engelsk for øvelsens skyld ? vi står til rådighed mht. sproglige problemer. Men dansk er naturligvis også i orden. Rapportens længde skal stå i et rimeligt forhold til kursets pointtal, dvs. et print af rapporten inkl. grafer vil typisk fylde 15-20 sider. De færdige rapporter lægges på www, og der kan evt. senere blive en henvisning til dem fra disse web-sider. En oversigt over tidligere projekter, dog kun fra 1997-1999, kan ses ved at klikke her. Projektforløbet starter som nævnt knapt halvvejs gennem kurset, hvor deltagerne finder sammen i grupper og aftaler med hinanden og lærerne, hvad emnet skal være, hvad modellen konkret skal omhandle, og hvordan problemstillingen skal afgrænses. Tidligt i forløbet, når disse indledende beslutninger er truffet, præsenterer grupperne (hvis der er ønske herom) deres projektideer for hinanden ved et lille seminar, hvor man kan give hinanden spørgsmål og inspiration. Herefter følger det egentlige projektarbejde. Der vil løbende være mulighed for at få hjælp med opståede problemer hos de to lærere, som man blot kan opsøge på deres kontorer. Det anbefales dog at få en aftale, så man ikke risikerer at gå forgæves ? især med PEH, som arbejder på halvtid. Et par uger før rapporten skal afleveres, finder den egentlige projektpræsentation sted ved et seminar, hvor også de lærere fra andre institutter, som evt. har været rådspurgt om faglige aspekter, vil blive inviteret. Der er stadig mulighed på dette seminar for at få kritik og ideer, som kan indgå i den endelige rapport. Desuden vil der på denne dag blive gennemført en mundtlig evaluering af kurset. Præsentationsdagen(e) aftales i begyndelsen af februar.

En liste af udarbejdede projekter i perioden 1997-1999 findes under Projekter 1997-1999.

Eksamen

Aflevering af rapport. Karakter: bestået/ikke bestået

Deltagere

Opdateres senere.

kvl-logo
Author: henrikp@dina.kvl.dk